Την προσθήκη στην ονομασία τους του όρου «Αρχιεπισκοπή της Οχρίδας» αποφάσισε η αυτοαποκαλούμενη «Μακεδονική Ορθόδοξη Εκκλησία».
Ο προκαθήμενός της, μητροπολίτης Τιμόθεος, αρνήθηκε πάντως ότι η απόφαση ελήφθη εξαιτίας της διαφοράς με την Ελλάδα για την ονομασία της ΠΓΔΜ, σημειώνοντας ότι στην επικοινωνία θα χρησιμοποιείται μόνο η ονομασία "Μακεδονική Ορθόδοξη Εκκλησία". Αποφασίστηκε επίσης η αλλαγή της σφραγίδας της Εκκλησίας, ώστε να απεικονίζει πλέον την Εκκλησία της Αγίας Σοφίας, που βρίσκεται στην Οχρίδα και όχι τον Άγιο Κλήμη.
Η Εκκλησία της ΠΓΔΜ αποσχίστηκε από τη σερβική ορθόδοξη εκκλησία το 1967 και δεν αναγνωρίζεται από καμία επίσημη ορθόδοξη εκκλησία στον κόσμο.