Έξι γενικές διευθύνσεις, μοιρασμένες ανάμεσα σε Ρόδο και Ερμούπολη, οι οποίες θα εδρεύουν στον Πειραιά, αναμένεται να διοικούν την περιφέρεια Νοτίου Αιγαίου, με βάση τον «Καλλικράτη», σύμφωνα με τα όσα ανακοίνωσε το υπουργείο Εσωτερικών.
Έδρα της περιφέρειας είναι η Ερμούπολη της Σύρου όπου και θα εδρεύουν οι 3 Γενικές διευθύνσεις, ενώ οι άλλες 3 θα είναι στην Ρόδο.
Οι έξι αυτές διευθύνσεις θα υπάγονται ως επιτελικές κρατικές υπηρεσίες, στην ενιαία Αποκεντρωμένη Διοίκηση Αιγαίου που δημιουργείται με έδρα τον Πειραιά.